Mikrobiolog DNA-sekvensering - SSI København S

Har du stor erfaring inden for mikrobiologi og brænder du for udvikling og optimering af metoder til udbrudsopsporing af bakterier? Har du desuden erfaring med Fourier-Transform Infrarød (FT-IR) spektroskopi samt alle trin inden for Nanopore sekvensering i i kan du lide at lære fra dig? Hvis du kan svare ja til ovenstående er du måske vores nye kollega.

Om afdelingen

Afdelingen for Bakterier, Parasitter & Svampe, der er en del af Statens Serum Institut, består af ca. 130 medarbejdere, der arbejder tæt sammen med andre fagområder indenfor smitteberedskabet for at yde diagnostisk eller epidemiologisk overvågning af humane infektioner. Afdelingen udfører desuden specialdiagnostiske analyser med tilhørende rådgivning om forebyggelse, diagnose og behandling.

Jobbets indhold

Du vil være tilknyttet Referencelaboratoriet for Antibiotikaresistens, som tæller 20 højt specialiseret kollegaer med viden om laboratoriebaseret overvågning af resistente bakterier. Sekvensering er rygraden i overvågningen og udbrudshåndtering og SSI sekvenserer ca. 10.000 bakteriegenomer om året primært til Illumina data.

Du skal indgå i et team der bl.a. arbejder med hurtig diagnostik og smitteopsporing af multiresistente bakterier med formål at styrke det nationale beredskab. Dette gøres vha. undersøgelse og implementering af hurtige typningsmetoder som f.eks. FT-IR spektroskopi og ONT sekvensering (Oxford Nanopore Technology). Derudover skal du være en del af et undervisningsteam der skal hjælpe med at implementere ONT sekvensering på landets hospitaler.

Din baggrund

Du har en akademisk uddannelse som molekylærbiolog eller lignende og har stor erfaring indenfor mikrobiologi, DNA sekvensering og databehandling. Vi forventer, at du har praktisk erfaring med udførelse, undersøgelse og implementering af metoder, såsom FT-IR spektroskopi og Nanopore sekvensering, til hurtig detektion af bakterielle patogener, antibiotikaresistensgener og deres vektorer (plasmider).

Du er opsøgende i forhold til forbedring af laboratorie- og analysemetoder og trives både i laboratoriet såvel som at fordybe dig i optimeret anvendelse af machine learning algoritmer til analyse af komplekse datasæt og UNIX-baserede programmer til helgenomanalyser. Du har herudover erfaring med programmering i Bash, Python, og R.

Det er en fordel, hvis du har praktisk erfaring med udvikling af undervisningsmateriale til faglig og kreativ formidling inden for naturvidenskab/mikrobiologi.

Som person er du struktureret og omhyggelig. Du trives med mange forskelligartede arbejdsopgaver og du besidder et stort overblik. Du har gode kommunikations- og samarbejdsevner og du ser værdien i at bidrage til et godt, tværfagligt arbejdsmiljø.

Vi tilbyder

Dine evner og dit engagement bidrager til at løse vores fælles kerneopgave.

SSI er en arbejdsplads, der er internationalt anerkendt for at løse nationale og globale sundhedsopgaver. Du bliver en del af en organisation med 900 medarbejdere, der løfter meningsfulde opgaver, som styrker menneskers og dyrs sundhed gennem forskning og beredskab.

Vores hverdag er præget af mange forskelligartede opgaver, åbne døre og et bredt samarbejde med engagerede og dygtige kollegaer. Du får mulighed for en fleksibel hverdag med en god balance mellem arbejde og fritid, da SSI er en arbejdsplads med en 37-timers arbejdsuge inkl. frokostpause, flekstidsaftale samt mulighed for hjemmearbejde afhængigt af arbejdsopgaver / fleksibel arbejdstidstilrettelæggelse.

På SSI har vi en aktiv personale- og idrætsforening (IK-SERA) med holdtræning og motionslokaler, fredagsbar og forskellige sociale arrangementer – og vores Campus rummer endda både tennisbaner og egen børneinstitution. SSI er placeret centralt beliggende i København med grønne arealer og gode offentlige transportmuligheder (bus og metro) og har fri parkering på området.

Lyder jobbet som noget for dig?

Send os dit CV og ansøgning. Vi beder dig om ikke at indsætte et foto i dit CV, da vi bestræber os for en mere inkluderende rekrutteringsproces med lige muligheder for alle vores jobansøgere.

Vi forventer at afholde samtaler fra uge 22.

Har du yderligere spørgsmål til stillingen eller ansøgningsprocessen kan du kontakte Anders Rhod Larsen på telefon +45 3268 8674.

Dine ansættelsesvilkår

Du bliver ansat som akademisk medarbejder efter gældende overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation.

Vi ser frem til at høre fra dig.

Denne stilling er publiceret af SSI via jobnet.dk