Bioinformatiker ctDNA-analyse - Odense Universitetshospital
Postdoc inden for molekylærbiologi/bioinformatik søges til Klinisk Genom Center på Odense Universitetshospital fra 1. november 2026. Du skal optimere tumor-informeret ctDNA-analyse med helgenom-sekventeringsdata og udvikle metoder til tumor-agnostisk analyse. Erfaring med bioinformatiske metoder som alignment, variant calling og machine learning forudsættes. Ph.d. inden for molekylærgenetik eller bioinformatik er påkrævet. Ansøgningsfrist: 18. september 2026.
Post doc., naturvidenskab og teknik stilling ved Odense Universitets Hospital, Region Syddanmark
- Odense, Region Syddanmark
- Fuldtid
- Ordinaert
- 1 ledig stilling
- Ansøgningsfrist: 18. september 2026 — Om 6 dage
- Oprettet: 3. september 2026
Beskrivelse af jobtilbuddet for Post doc., naturvidenskab og teknik
Klinisk Genom Center søger pr. 1. november 2026 en postdoc med baggrund som molekylærbiolog/bioinformatiker til ansættelse i 1 år og 4 måneder med mulighed for forlængelse. Stillingen er med ugentlig arbejdstid på 37 timer/uge. Centeret er en forskerstøtte- og core facility for globale genomanalyser og bioinformatik. Det hører under Syddansk Universitet og Region Syddanmark og er placeret på Klinisk Genetisk Afdeling, Odense Universitetshospital. Stillingen er knyttet til MONITOR-ctDNA-projektet. I dette projekt undersøges værdien af cirkulerende tumor-DNA til tidlig opsporing af progression og tilbagefald af metastatisk brystkræft. Patienterne, der indgår i projektet, vil også blive undersøgt med PET- og CT-scanning i MONITOR-RCT-studiet.
Projektet er finansieret af EU som en del af en stor bevilling til MONITOR-projektet. Bevillingshaver er Malene Grubbe Hildebrand fra Nuklearmedicinsk Afdeling, OUH.
Dine primære opgaver bliver:
- Optimere metode til tumor-informeret ctDNA-analyse med helgenom-sekventeringsdata (WGS-data).
- Udvikle metoder til tumor-agnostisk analyse af ctDNA.
- Analyse af serielle prøver fra patienter i MONITOR-projektet.
- Udvikling af kriterier for progression.
- Sammenligning af performance med PET/PET-CT data.
Bioinformatiske metoder:
- Analyse af WGS-data herunder alignment, variant calling, fragmentomics, force calling, noise reduction og machine learning.
- Udvikling af metoder til tumor-agnostisk analyse ved brug af tumorgenomisk instabilitet, mutations signaturer m.m.
Vi forventer, at du:
- Har erfaring med en eller flere af de nævnte bioinformatiske metoder.
- Kan arbejde selvstændigt med optimering og problemløsning på analyser.
- Er velstruktureret og interesseret i at optimere bioinformatiske metoder.
- Er initiativrig og kvalitetsbevidst.
- Trives med at have mange bolde i luften.
- Har ph.d. inden for molekylærgenetik/bioinformatik.
Vi tilbyder:
- Tæt tværfagligt samarbejde med forskere og afdelingens øvrige personale.
- En alsidig og udfordrende hverdag med rig mulighed for at lære nyt.
- Et godt arbejdsmiljø, hvor der er respekt for den enkelte.
- Fleksibilitet i tilrettelæggelsen af egen arbejdsdag.
Hvis du har spørgsmål:
Kan du henvende dig til professor Mads Thomassen, tlf.: 6541 2839 / 2233 6643 eller pr. mail: mads.thomassen@rsyd.dk
Løn og ansættelsesforhold:
I henhold til overenskomst mellem Regionernes Lønnings-og takstnævn og relevant faglig organisation. Regionen er forpligtet til at oplyse dig om startlønnen for stillingen. Du får oplyst grundløn, centralt fastsatte tillæg og pension i Akademikere – overenskomst 33.01.1 – løn pr. 1.4.2026. Udover startlønnen, kan lønnen indeholde eventuelt forhandlede tillæg afhængigt af stillingen, dine erfaringer og kvalifikationer.
Læs mere her startløn for stillinger i Region Syddanmark
Denne stilling er publiceret af Odense Universitets Hospital via jobnet.dk